49ca99a7-6e54-48f8-ac75-a15116f1a308 Nicolas WALCKER OTHU Villeurbanne 69100 France nicolas.walcker@insa-lyon.fr http://graie.org/othu/index.htm WWW:LINK-1.0-http--link OTHU Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine 2026-02-16T12:51:13 ISO 19115:2003/19139 1.0 Construction d’une librairie de séquences du gène 16S rRNA de qualité internationale pour évaluer l’impact des contaminations fécales humaines et non-humaines sur les surfaces de la métropole de Lyon et les eaux de ruissellement 2025-04 - DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données de séquençage du segment V4 de du gène de l’ARNr 16S pour les pelotes fécales de 5 mammifères (homme, chat, chien, mouton, campagnol) - FORMAT : Tableau Excel contenant le descriptif des échantillons, et les tables de contingence. - CONTEXTE : Ces données ont été produites dans le cadre des activités de l'OTHU et s'inscrivent dans les travaux multidisciplinaires de BPOE-LEM. Le but est la création d'une base de données de référence du gène 16S rRNA pour pouvoir par la suite identifier les sources de contamination fécale dans la métropole de Lyon. Cette base de données sera enrichie au fil du temps dès de nouveaux échantillons seront obtenus. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - LIEU : Métropole de Lyon, Auvergne - PÉRIODE : 2025-maintenant construction d’une librairie de séquences du gène 16S rRNA de qualité internationale Benoit COURNOYER Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE France benoit.cournoyer@vetagro-sup.fr http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1 WWW:LINK-1.0-http--link Baptiste LUTON CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE baptiste.luton@univ-lyon1.fr Wessam GALIA VetAgro Sup- LEM BPOE wessam.galia@vetagro-sup.fr Installations de suivi environnemental GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 2008-06-01 geonetwork.thesaurus.external.theme.httpinspireeceuropaeutheme-theme micro-organisme pollution eau bactérie fécale GEMET 2018-08-16 geonetwork.thesaurus.external.theme.gemet Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity theme.OZCAR-Theia.rdf 2023-04-05 geonetwork.thesaurus.external.theme.OZCAR-Theia SNO Observil ZABR Sites OTHU 2023-04-05 geonetwork.thesaurus.external.place.sites-othu LYON MARCY-L'ETOILE Emprises du Grand Lyon et périphériques 2014-05-05 geonetwork.thesaurus.external.place.EmprisesGL Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention environment inlandWaters 2025-01-01 LYON LYON 4.6495 4.9912 45.663 45.8045 LYON txt/csv https://download.data.grandlyon.com/files/grandlyon/LicenceOuverte.pdf WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download Licence Ouverte http://graie.org/othu/index.htm WWW:LINK-1.0-http--related OTHU site web règlement (ue) n o 1089/2010 de la commission du 23 novembre 2010 portant modalités d'application de la directive 2007/2/ce du parlement européen et du conseil en ce qui concerne l'interopérabilité des séries et des services de données géographiques 2010-11-23 Non évalué false producteur: UMR LEM - BPOE. Des ADN des pelotes de fèces ont été extraits et envoyés à séquencer par novogene pour la région V4 de l'ARNr 16S. Les tables de contingence ont ensuite été réalisées. Les séquences sont assignées taxonomiquement et le nombre d'asv pour chaque échantillon est compté.