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Qualité microbiologique – adaptation de l’approche idexx pour étudier les taux de bactéries résistantes (et multi-résistantes) aux antibiotiques sur les surfaces de la Métropole de Lyon et dans les eaux de ruissellement

Description détaillée :

Des données de quantification bactérienne ont été obtenues pour 4 groupes bactériens (hétérotrophes, entérocoques, E.coli et Pseudomonas aeruginosa) avec la méthode cultivable et normalisée IDEXX, sur sédiments et eaux de ruissellement urbains collectés au site Django-R. La population microbienne multirésistante de plusieurs de ces groupes a également été quantifiée.

- FORMAT

Tableau excel avec onglets indiquant les données physicochimiques, les quantifications microbiologiques selon les matrices et les points de prélèvement des sédiments étudiés.

- CONTEXTE :

Les données présentées ont été produites par l’équipe UMR LEM–BPOE dans le cadre des projets de l’OTHU, dédiés à l’analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales, en particulier les ruissellements urbains.

L’objectif de ces travaux est d’évaluer la contamination microbiologique de ces milieux ainsi que la présence de bactéries tolérantes ou résistantes aux antibiotiques, à partir de matrices solides (sédiments) et liquides (eaux de ruissellement).

Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans


- LIEU : Métropole de Lyon et périphérie

- PÉRIODE :entre novembre 2025 et janvier 2026

Simple

Date (Creation)
2025-11
Purpose

Caractériser la population microbienne sur les surfaces urbaines et le danger sanitaire associé (notamment sur la résistance aux antibiotiques)

Status
On going
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Custodian
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON
Author
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON
Maintenance and update frequency
As needed
Author
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

  • Installations de suivi environnemental

GEMET

  • eau pluviale

  • micro-organisme

  • sédiment

  • antibiotique

  • pollution de la ville

theme.OZCAR-Theia.rdf

  • Bacteria and virus abundance

  • Bacteria and virus diversity

Keywords
  • SNO Observil

  • ZABR

Sites OTHU

  • Chassieu Rétention/Infiltration

Emprises du Grand Lyon et périphériques

  • Emprises GrandLyon

Use limitation

Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif

Access constraints
Copyright
Use constraints
Other restrictions
Other constraints

Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention

Spatial resolution

No information provided.
Language
Français
Character set
UTF8
Topic category
  • Environment
  • Inland waters
Begin date
2025-11-01
End date
2026-01-20
Description

Chassieu Rétention/Infiltration

N
S
E
W
thumbnail


Distribution format
  • txt/csv ( )

OnLine resource
Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
OnLine resource
OTHU site web ( WWW:LINK-1.0-http--related )
Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date (Publication)
2010-11-23
Explanation

Non évalué

Pass
No
Statement

producteur: UMR LEM - BPOE; dénombrement de bactéries viables issues d'eau de surface ou de sédiments, quantification réalisée par la méthode IDEXX en présence ou non d'antibiotiques. Les données brutes étaient des comptage de puits fluorescents sur plaque IDEXX. Ensuite ces données ont été entrées dans le logiciel IDEXX MNP Générator qui convertit les résultats sous la forme de Nombre le Plus Probable (NPP). Et pour finir ces données ont été normalisées par 100 mL ou par gramme de poids sec. Les données physicochimiques mesurées sont aussi indiquées.

File identifier
a6ef42de-d1f1-4caa-962a-d31e07ef44c8 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2026-02-16T12:39:53
Metadata standard name

ISO 19115:2003/19139

Metadata standard version

1.0

Point of contact
  OTHU - Nicolas WALCKER
Villeurbanne , 69100 , France
http://graie.org/othu/index.htm
 
 

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N
S
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Keywords

GEMET
antibiotique eau pluviale micro-organisme pollution de la ville sédiment
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Installations de suivi environnemental
theme.OZCAR-Theia.rdf
Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity

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