Contexte scientifique Le bassin versant de l’Yzeron (150 km2) est situé dans les Monts du Lyonnais à l’ouest de la ville de Lyon, en France. Il fait partie de l’Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine (OTHU). C’est un bassin périurbain, caractérisé par une topographie marquée (de 162 à 917 m). La géologie est contrastée avec des formations granitiques dans la partie ouest du bassin et des formations glaciaires et alluviales dans la partie est. L’occupation du sol est très hétérogène, avec un amont forestier, une partie intermédiaire agricole (cultures et prairies) mélangée à des noyaux urbains et une partie aval densément urbanisée. L’urbanisation a progressé rapidement depuis les années 1970. Le bassin est soumis à un climat tempéré avec des épisodes pluvieux intenses de type méditerranéen et des crues éclair du fait des fortes pentes et de faibles capacités de stockage dans le sol. Le réseau hydrographique est doublé de réseaux d’eau pluviale majoritairement unitaires, équipés de déversoirs d’orage (DO) se déversant dans les cours d’eau quand le réseau déborde. Cette eau est riche en polluants et en sédiments, ce qui dégrade la qualité des cours d’eau, en particulier en été quand les DOs sont les seules sources d’alimentation de la rivière. L’érosion accrue des berges des rivières a également été mise en évidence, ce qui a un impact sur les écosystèmes

Campagnes de prélèvements et d'analyses des eaux souterraines issues des piézomètres des bassins d'infiltration de l'est lyonnais (paramètres globaux, nutriments, métaux et HAP) Campagnes réalisées aux 4 saisons, en amont et en aval des bassins d'infiltration (Chassieu, IUT, Minerve, Granges Blanches) Ajout en 2015 de Chemin de Feyzin (Mions) et Chemin de Raquin (Chassieu) -remplacé par Pesselière (Mions) en 2017- Depuis 2020, les campagnes se concentrent uniquement sur les bassins de Chassieu et de l'IUT (Campus, Villeurbanne).

Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

Suivi des nombreux paramètres relatifs au bassin de rétention et au bassin d'infiltration: - Quantité et qualité des effluents à l'entrée et à la sortie d'un bassin de rétention - Niveau et qualité de la nappe phréatique - Pollution des sédiments du bassin de rétention - Suivi faunistique et floristique du bassin d'infiltration - Capacité d'infiltration du bassin d'infiltration - Paramètres météorologiques - ...

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'exutoire d'un bassin versant industriel de 185 hectares. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

Mise à jour et interprétation des banques de données métagénomiques issues de séquençage massif afin d'obtenir une image de la communauté microbienne des eaux de ruissellement, de la nappe et/ou des sédiments Analyse qualitative des communautés bactériennes présentes dans le milieu (métataxogénomique) Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), sites satellites (Feyzin, Minerve, Raquin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)

Projet CABRRES: Caractérisation chimique, microbiologique, écotoxicologique, spatio-temporelle des contaminantes des bassins de retenue des eaux pluviales urbaines (2012 à 2017); évaluation et gestion des Risques Environnementaux et Sanitaires associés: - Identification des sources des contaminants - Développement d'un modèle hydrodynamique - Caractérisation biophysico-chimique des zones de contamination - Caractérisation écotoxicologique des mêmes échantillons - Etablissement de corrélations entre tailles des particules et agents

Suivi de la microbiologie au sein des sédiments et/ou des eaux de surface sur les sites de l'OTHU; estimation de la concentration en bactérie: - suivi bactéries hétérotrophes totales, bactéries bio-indicatrices de contamination fécale, Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas caviae... - étude relation avec la physico-chimie (pH, conductivité électrique, turbidité, O2, ORP) - quantification bactéroidales, charge bactérienne et intégrons (classe I, II, III) par PCR quantitative Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), BV Yzeron (Ratier, Mercier, Chaudanne), sites satellites (Minerve, Raquin, Feyzin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)

Campagnes de suivi de la microbiologie des sédiments et des eaux de la rivière Chaudanne sur le site de Grézieu-la-Varenne depuis 2013: - Analyses des eaux en amont, aval et au sein du DO ainsi qu'en réseau unitaire - Analyses métagénomiques au niveau des eaux de surface, des sédiments benthiques et eaux hyporhéiques - Suivi des bactéries pathogènes - Microbiologie du modèle P.aeruginosa, du modèle A.caviae, des bactéries hétérotrophes et des bio-indicateurs de contamination fécale - PCR quantitative pour évaluation de marqueurs permettant la quantification de pathogènes au cours de campagnes nycthémérales - PCR quantitative pour évaluation d'un marqueur permettant la quantification de la présence d'intégrons (classe I, II, III et classe I "clinique")

données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)