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  • Projet CABRRES: Caractérisation chimique, microbiologique, écotoxicologique, spatio-temporelle des contaminantes des bassins de retenue des eaux pluviales urbaines (2012 à 2017); évaluation et gestion des Risques Environnementaux et Sanitaires associés: - Identification des sources des contaminants - Développement d'un modèle hydrodynamique - Caractérisation biophysico-chimique des zones de contamination - Caractérisation écotoxicologique des mêmes échantillons - Etablissement de corrélations entre tailles des particules et agents

  • Suivi de la microbiologie au sein des sédiments et/ou des eaux de surface sur les sites de l'OTHU; estimation de la concentration en bactérie: - suivi bactéries hétérotrophes totales, bactéries bio-indicatrices de contamination fécale, Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas caviae... - étude relation avec la physico-chimie (pH, conductivité électrique, turbidité, O2, ORP) - quantification bactéroidales, charge bactérienne et intégrons (classe I, II, III) par PCR quantitative Sites OTHU: Django-Reinhart (Chassieu), BV Yzeron (Ratier, Mercier, Chaudanne), sites satellites (Minerve, Raquin, Feyzin) Autre(s): Garibaldi (Lyon)

  • - Description générale : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés microbiennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface ont été analysées en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et dénombrement IDEXX. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, dénombrement IDEXX, eaux de surface - physico-chimie, suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire/intégrité cellulaire, données de cytométrie) - contexte: Développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires afin de caractériser le degré d'infectiosité de microorganismes d'eaux de surfaces. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés du milieu. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: novembre 2023

  • Campagnes de suivi de la microbiologie des sédiments et des eaux de la rivière Chaudanne sur le site de Grézieu-la-Varenne depuis 2013: - Analyses des eaux en amont, aval et au sein du DO ainsi qu'en réseau unitaire - Analyses métagénomiques au niveau des eaux de surface, des sédiments benthiques et eaux hyporhéiques - Suivi des bactéries pathogènes - Microbiologie du modèle P.aeruginosa, du modèle A.caviae, des bactéries hétérotrophes et des bio-indicateurs de contamination fécale - PCR quantitative pour évaluation de marqueurs permettant la quantification de pathogènes au cours de campagnes nycthémérales - PCR quantitative pour évaluation d'un marqueur permettant la quantification de la présence d'intégrons (classe I, II, III et classe I "clinique")

  • Evaluation de l'effet d'invertébrés (vers tubificidés) sur la dynamique des nutriments dissous, des activités microbiennes et de la composition chimique des sédiments en colonnes expérimentales. Sites: IUT, Minerve, Granges Blanches, Django-Reinhardt, site témoin -Balan- Collecte de sédiments et mise en place de colonnes expérimentales (6 colonnes par sédiment - 3 avec des vers tubificidés et 3 sans vers tubificidés) Mesures réalisées : - Dynamique des nutriments (NO3, NO2, NH4, PO4) et du carbone organique dissous dans l'eau en contact avec les sédiments - Analyse de deux gaz à effet de serre (CO2 et CH4) - Analyse des teneurs en carbone organique, azote et phosphore dans les sédiments - Analyse de la réponse écophysiologique des vers aux différents sédiments (mesures des réserves énergétiques et des indicateurs de stress oxydatif) - Analyses tomographiques (scanner médical) pour évaluer la bioturbation (création de galeries) par les vers tubificidés

  • Caractériser et quantifier la qualité des eaux souterraines à l’aval de dispositifs d’ouvrages d’infiltration- classique bassin Etude des flux d’eau et de polluants, de la biodiversité produit par un BV muni de techniques alternatives innovantes de gestion des eaux pluviales (e.g. toiture végétalisée, chaussées réservoir, noues, etc.). avec un attention particulière sur l’analyse performancielle de ces techniques sur le plan hydraulique, environnemental et énergétique

  • Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

  • - description générale: données de qualité (protéines totales, INT - respiration, FDA - métabolisme générale) concernant la formation de biofilms sur germcatchers en rivière (BV Ratier/Mercier de l'Yzeron) associées à des données produites à partir d'ADN extraits de ces biofilms. Des jeux de données concernant la qualité microbiologique des biofilms (via l'ADN) ont été produits par qPCR et méta-barcoding d'amplicons du gène marqueur tpm. Des eaux de surface ont été analysées durant cette étude pour qualifier les périodes d'échantillonnage en termes de paramètres physico-chimiques et permettre des comparaisons entre microbiologie des biofilms et des eaux de surface (uniquement via qPCR et méta-barcoding d'amplicons). - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (biofilms, ADN, eaux de surface - physico-chimie) - contexte: L'étude des biofilms sur germcatchers permet de tester les aptitudes des bactéries de sources exogènes (animales, surverse de réseau unitaire) dont des formes pathogènes à coloniser les compartiments d’un cours d’eau dans un contexte (i) de compétition avec les composantes biologiques naturelles du cours d’eau mais également (ii) d’exposition à de multiples polluants chimiques dont des phytosanitaires et pharmaceutiques. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars à juin 2023

  • Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'entrée d'un bassin d'infiltration. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

  • Evaluation des performances hydrauliques de techniques alternatives (parking asphalté, chaussée poreuse, noue, tranchée) Paramètres hydrauliques: débits (augets, électromagnétiques) depuis 2017 Paramètres physico-chimiques: Température et conductivité électrique de 2017 à juin 2019