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  • - Description générale : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés microbiennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface ont été analysées en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et dénombrement IDEXX. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, dénombrement IDEXX, eaux de surface - physico-chimie, suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire/intégrité cellulaire, données de cytométrie) - contexte: Développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires afin de caractériser le degré d'infectiosité de microorganismes d'eaux de surfaces. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés du milieu. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: novembre 2023

  • Campagnes de suivi de la microbiologie des sédiments et des eaux de la rivière Chaudanne sur le site de Grézieu-la-Varenne depuis 2013: - Analyses des eaux en amont, aval et au sein du DO ainsi qu'en réseau unitaire - Analyses métagénomiques au niveau des eaux de surface, des sédiments benthiques et eaux hyporhéiques - Suivi des bactéries pathogènes - Microbiologie du modèle P.aeruginosa, du modèle A.caviae, des bactéries hétérotrophes et des bio-indicateurs de contamination fécale - PCR quantitative pour évaluation de marqueurs permettant la quantification de pathogènes au cours de campagnes nycthémérales - PCR quantitative pour évaluation d'un marqueur permettant la quantification de la présence d'intégrons (classe I, II, III et classe I "clinique")

  • Evaluation de l'effet d'invertébrés (vers tubificidés) sur la dynamique des nutriments dissous, des activités microbiennes et de la composition chimique des sédiments en colonnes expérimentales. Sites: IUT, Minerve, Granges Blanches, Django-Reinhardt, site témoin -Balan- Collecte de sédiments et mise en place de colonnes expérimentales (6 colonnes par sédiment - 3 avec des vers tubificidés et 3 sans vers tubificidés) Mesures réalisées : - Dynamique des nutriments (NO3, NO2, NH4, PO4) et du carbone organique dissous dans l'eau en contact avec les sédiments - Analyse de deux gaz à effet de serre (CO2 et CH4) - Analyse des teneurs en carbone organique, azote et phosphore dans les sédiments - Analyse de la réponse écophysiologique des vers aux différents sédiments (mesures des réserves énergétiques et des indicateurs de stress oxydatif) - Analyses tomographiques (scanner médical) pour évaluer la bioturbation (création de galeries) par les vers tubificidés

  • Suivi de l'impact de l'infiltration sur la qualité des eaux souterraines sous le bassin d'infiltration de Django Reinhart Le dispositif expérimental est basé sur un ensemble de piézomètres situés à l'amont hydraulique du bassin d'infiltration (piézomètres SC1 à SC6), à l'aplomb du bassin d'infiltration (piézomètres SC7 à SC11), en position latérale gauche (piézomètres SC12, SC26 et SC27) et droite (piézomètre SC13) du bassin d'infiltration et disposés à l’aval du bassin (piézomètres SC28, SC29 et SC14). Enregistrements continus sur plusieurs piézomètres depuis 2003 (palier horaire): - hauteur d'eau - température - conductivité électrique - oxygène dissous

  • description générale: des jeux de données concernant la qualité microbiologique des eaux de surface (via l'ADN) du bassin-versant de l'Yzeron en période de temps sec ont été produits par qPCR via la trousse qPCR OTHU. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (ADN, résultats qPCR des eaux de surface) - Contexte Ces travaux permettent d’étudier les mélanges de bactéries exogènes (incluant des agents pathogènes) et endogènes du cours d’eau en période de temps sec. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars 2023

  • Suivi de l'impact de l'infiltration sur la qualité des eaux souterraines pour 5 bassins d'infiltration de l'est lyonnais (sur les communes de Chassieu, Corbas, Mions, St Priest) Enregistrement continu sur les piézomètres depuis 2006 (palier horaire) jusqu'en 2020 : - hauteur d'eau - température - conductivité électrique - oxygène dissous (Minerve, Granges Blanches, Chemin de Raquin, Pesselière, Chemin de Feyzin)

  • Campagnes de prélèvements et d'analyses des eaux souterraines issues des piézomètres des bassins d'infiltration de l'est lyonnais (paramètres globaux, nutriments, métaux et HAP) Campagnes réalisées aux 4 saisons, en amont et en aval des bassins d'infiltration (Chassieu, IUT, Minerve, Granges Blanches) Ajout en 2015 de Chemin de Feyzin (Mions) et Chemin de Raquin (Chassieu) -remplacé par Pesselière (Mions) en 2017- Depuis 2020, les campagnes se concentrent uniquement sur les bassins de Chassieu et de l'IUT (Campus, Villeurbanne).

  • Etude de l'évolution et de la variabilité des quantités et de la qualité des eaux urbaines en temps de pluie sur la dernière décennie – Capitalisation des chroniques de l'OTHU (projet CHRONOTHU - ZABR)- 2015 Ce projet vise à étudier la tendance d’évolution à long terme de variables caractérisant la quantité et la qualité des eaux transitant dans le milieu urbain. Il est basé presqu’exclusivement sur les données collectées et mesurées sur plus de 10 ans dans l’OTHU sur le site de Chassieu, Ecully et Yzeron (Bassin La Léchère)

  • Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

  • Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'exutoire d'un bassin versant industriel de 185 hectares. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)