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  • - Description générale : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés microbiennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface ont été analysées en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et dénombrement IDEXX. - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, dénombrement IDEXX, eaux de surface - physico-chimie, suivi en temps réel de l'index/intégrité cellulaire/intégrité cellulaire, données de cytométrie) - contexte: Développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires afin de caractériser le degré d'infectiosité de microorganismes d'eaux de surfaces. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés du milieu. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: novembre 2023

  • Données produites depuis 2016 dans le cadre de l'OTHU pour le suivi des paramètres météorologiques. Station météo:Campbell SCI CR310. Paramètres suivis: température, humidité de l'air, ensoleillement, vitesse et orientation du vent et pluviométrie (depuis 2016)

  • données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)

  • - description générale: données de qualité (protéines totales, INT - respiration, FDA - métabolisme générale) concernant la formation de biofilms sur germcatchers en rivière (BV Ratier/Mercier de l'Yzeron) associées à des données produites à partir d'ADN extraits de ces biofilms. Des jeux de données concernant la qualité microbiologique des biofilms (via l'ADN) ont été produits par qPCR et méta-barcoding d'amplicons du gène marqueur tpm. Des eaux de surface ont été analysées durant cette étude pour qualifier les périodes d'échantillonnage en termes de paramètres physico-chimiques et permettre des comparaisons entre microbiologie des biofilms et des eaux de surface (uniquement via qPCR et méta-barcoding d'amplicons). - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (biofilms, ADN, eaux de surface - physico-chimie) - contexte: L'étude des biofilms sur germcatchers permet de tester les aptitudes des bactéries de sources exogènes (animales, surverse de réseau unitaire) dont des formes pathogènes à coloniser les compartiments d’un cours d’eau dans un contexte (i) de compétition avec les composantes biologiques naturelles du cours d’eau mais également (ii) d’exposition à de multiples polluants chimiques dont des phytosanitaires et pharmaceutiques. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars à juin 2023

  • Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

  • Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'exutoire d'un bassin versant industriel de 185 hectares. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

  • Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'entrée d'un bassin d'infiltration. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

  • Evaluation des performances hydrauliques de techniques alternatives (parking asphalté, chaussée poreuse, noue, tranchée) Paramètres hydrauliques: débits (augets, électromagnétiques) depuis 2017 Paramètres physico-chimiques: Température et conductivité électrique de 2017 à juin 2019

  • Campagne de collectes de sédiments sur plusieurs bassins d'infiltration de la métropole Mesures des quantité de raticides dans les matrices sédimentaires Evaluation en laboratoire de l'impact des raticides sur un organisme sentinelle aquatique vivant dans ces sédiments (le vers tubificidé Tubifex tubifex) Mesures écophysiologiques réalisées : réserves énergétiques chez les organismes + à compléter

  • -Caractéristiques physico-chimiques, concentrations en métaux lourds, HAP, hydrocarbures Totaux, Azote et phosphore totaux de sols de quatre bassins d’infiltration en différents points et différentes profondeurs. - Thèse de Magali Dechesne - Données principalement sous fichiers Excel (fichier joint) - Sites: Sites satellites (Boulevard des droits de l’homme, Centre routier, ZAC Pivolles, ZAC du Chêne)