- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : (données ponctuelles par sites) données : infiltration, couverture végétale, plants species, soil microbiology (taxa abundance, diversity), soil texture, soil structure, porosity, site geometry, occupation des sols - FORMAT : tableau de données - CONTEXTE : Projet europpéen BIORESTORM & thèse de doctorat - BUT : Amelioration de la compréhension des mecanismes biologiques qui influencent la fonction infiltration des solution fondées sur la nature pour la gestion de l'eau pluviale en ville - LIEU : DJANGO et autres noues non suivies par l'OTHU (LYON) - PÉRIODE : été 2025 et 2026

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

- DESCRIPTION DE LA DONNÉE: Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron via l'utilisation de pièges passifs (billes d'argile / germcatchers) favorables au développement de biofilms. Les germcatchers ont été positionnés à l'exutoire du Ratier - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement des germcatchers (billes d'argile) étudiés - CONTEXTE (DANS LE CADRE DE QUEL PROJET? QUI EST LE PROPRIÉTAIRE?...) Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales dont les ruissellements urbains - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU exutoire du bassin-versant du Ratier - PÉRIODE positionnement en rivière de germcatchers entre Avril - juin 2022

- DESCRIPTION Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron. Différents modes d’utilisation des terres ont été répertoriés et 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés pour les analyses des sources de contamination. Plusieurs campagnes de récolte d'eaux aux différentes sources ont été réalisées (10/02/22, 15/02/22, 17/05/22, 27/06/22 et 30/06/22) - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement étudiés - CONTEXTE Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU Bassin versant emboité Mercier-Ratier. 10 sous-bassins homogènes en terme d’activité et d'occupation des sols ont été sélectionnés. - PÉRIODE Campagnes 10/02/2022 (temps sec), 15/02/2022 (temps de pluie), 17/05/2022, 27/06/2022 et 30/06/2022.

Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données physicochimiques sur des sédiments urbains (pH, poids sec, ions, éléments traces métallique, N, P, Hydrocarbure aromatique polycyclique) échantillonnés sur 9 zones de la métropole de Lyon (avec 3 typologies) pendant 3 saisons. Ces données sont associées à d'autres concernant la qualité microbiologique de ces sédiments via qPCR des ADN avec les marqueurs de la trousse OTHU. Ces données sont complétées par des images produites par microscopie électronique à balayage des microorganismes présents. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (paramètres généraux, pH, Chimie, ADN, quantification qPCR) - CONTEXTE : L'étude des sédiments urbains en terme microbiologique et physicochimiques permets de faire le lien entre chimie et présence de microorganismes, et en particulier de pathogènes. Ces données sont associés à des images de microscopie électronique à balayage pour visualiser la diversité des formes microbiennes et les rendre accessibles au publique. Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des sédiments urbains remobilisés par temps de pluie au niveau de la métropole. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : métropole de Lyon - PÉRIODE : novembre 2023 à juin 2024

Description détaillée : Des données de quantification bactérienne ont été obtenues pour 4 groupes bactériens (hétérotrophes, entérocoques, E.coli et Pseudomonas aeruginosa) avec la méthode cultivable et normalisée IDEXX, sur sédiments et eaux de ruissellement urbains collectés au site Django-R. La population microbienne multirésistante de plusieurs de ces groupes a également été quantifiée. - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les données physicochimiques, les quantifications microbiologiques selon les matrices et les points de prélèvement des sédiments étudiés. - CONTEXTE : Les données présentées ont été produites par l’équipe UMR LEM–BPOE dans le cadre des projets de l’OTHU, dédiés à l’analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales, en particulier les ruissellements urbains. L’objectif de ces travaux est d’évaluer la contamination microbiologique de ces milieux ainsi que la présence de bactéries tolérantes ou résistantes aux antibiotiques, à partir de matrices solides (sédiments) et liquides (eaux de ruissellement). Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : Métropole de Lyon et périphérie - PÉRIODE :entre novembre 2025 et janvier 2026

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants à l'exutoire d'un bassin versant industriel de 185 hectares. Paramètres hydrauliques: Hauteurs, vitesses, débits (depuis 2004) Paramètres physico-chimiques: Température, pH, conductivité électrique, turbidité (depuis 2004)

données issues de travaux spécifiques réalisés sur le sous-bassin rural du Mercier, dans le cadre de la thèse de B. Sarrazin (2012)

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : données d'évaluation de l'infectiosité des communautés bactériennes issues d'eaux de surface du BV Yzeron et Django-R et de sédiments urbains issus de la métropole de Lyon sur des cellules d'épithéliums pulmonaires (suivie du cell index/intégrité cellulaire, données de cytométrie et microscopie). Les eaux de surface et les sédiments ont été analysés en terme de paramètres physicochimiques. Des données sur la qualité microbiologique des eaux de surface ont également été produites par qPCR et courbe de croissance/d'amplification des communautés bactériennes. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données ( ADN, physico-chimie, suivie du Cell index/,intégrité cellulaire, données de cytométrie, imagerie) - CONTEXTE : Continuation du développement de tests rapides sur épithéliums pulmonaires développés en 2022, 2023 afin de caractériser le degré d'infectiosité des bactéries d'eaux de surfaces et maintenant de sédiments. Ce test a été développé et appliqué aux eaux de surface BV Yzeron, de Django R et aux sédiments urbains issus de la métropole de Lyon et permet de faire le lien entre le degré de pollution chimique et l'infectiosité des communautés des milieux. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEUX : bassin-versant de l'Yzeron, Django-R, Métropole de Lyon (69, France) - PÉRIODE : Juin et Novembre 2024